Неліктен мұндай жоғары өнімді машиналар қажет? Бастапқыда суперкомпьютерлер әскери мақсаттарға ғана пайдаланылды. Олардың көмегімен ядролық және термоядролық қару бойынша есептер жасалды. Ақпараттық технологиялардың қарқынды дамуы мен оларды адам өмірі мен қоғамының барлық салаларында іске асыру барысында ең қуатты компьютерлер  күрделі есептеулерді талап ететін  салаларда қолданыла бастады. Бұл тізімде криптография, статистика, есептеу биологиясы және химия, физика, жер туралы ғылымдар (соның ішінде ауа райы болжамдары, үлкен судың күйі, климаттың өзгеруін болжау) және тағы басқалар бар.

Бұл супер-интеллектуалды жүйелердің арқасында көптеген ғылыми зерттеулер жүргізілді.Медицинадағы заманауи диагностика қол жетімді болды. Ауа райы мен табиғи құбылыстарды дәл болжауға мүмкіндік болды. Егер денсаулық сақтау секторын бөлек қарасақ, мұнда тек суперкомпьютердің  көмегімен тиімді емдеу әдістерін алуға және көптеген аурулардың себептерін анықтауға болады.

Әскери салада суперкомпьютерлер жаңа стратегиялық және тактикалық ұстанымдарды есептеуге, дайын әскери техниканың тиімділігін арттыру және оны жаңғыртуға, жаңа қару түрлері мен қорғау құралдарын игеруге мүмкіндік береді.